MathemaTeX

[pavel_vikanov]

Bonjour,

Le sujet étant verrouillé, je poste un nouveau sujet concernant la bibliographie.

Pour la bibliographie ; il faut essayer (pour la mise en forme) biblatex : souple, facile, paramétrable,... un régal. Il est sur CTAN, donc on le copie dans un répertoire où TeX peut le trouver. Il n'y a pas photos avec les autres possibilités.

Par contre, qu'est-ce que tu fais précisément pour construire ta biblio ?

En fait, pour le moment j'ai fais ma biblio avec endnote, une cinquantaine d'entrées. Ce que je voudrais, parce que j'ai lu que c'était faisable, c'est créer un fichier dans lequel je mets toutes mes références pendant ma thèse, comme ça à chaque fois que je rédige un truc j'ai déjà tout à disposition pour ne pas perdre de temps. Du coup, j'ai essayé de transposer les données endnote (pour ne pas avoir à tout retaper) en données lisibles par latex mais je n'ai pas l'impression que le format obtenu corresponde. Peut-être serait-il aussi simple que je refasse tout une bonne fois pour toute ! Dans ce cas où trouver un tuto m'expliquant bien comment créer mon *.bib etc ?

[pavel_vikanov]

PS : avec mon bidouillage actuel il me fait cette erreur :

Code: Tout sélectionner

./chartpage.bbl:1:TeX capacity exceeded, sorry [text input levels=15]. \begin{bibliography}{biblio_antoine}

[pavel_vikanov]

Bon, je fais ma réponse seul !

Comme ça me gonflait avec endnote j'ai essayé en créant une nouvelle biblio ***.bib et tout fonctionne : les références dans le texte et la mise en forme de la biblio. Après j'imagine qu'il y a moyen de modifier la mise en page. Parce que là il met des [1], [2] dans le texte et je trouve pas ça très pratique ! Mon petit doigt me dit que ça vient du style plain, non ?

[EricK]

Bon, je fais ma réponse seul !

Comme ça me gonflait avec endnote j'ai essayé en créant une nouvelle biblio ***.bib et tout fonctionne : les références dans le texte et la mise en forme de la biblio. Après j'imagine qu'il y a moyen de modifier la mise en page. Parce que là il met des [1], [2] dans le texte et je trouve pas ça très pratique ! Mon petit doigt me dit que ça vient du style plain, non ?

Tu choisis un style de biblio (par exemple natbib) et tu regardes les paramètres qui sont proposés avec.

Ensuite, tu varies les plaisirs en utilisant \cite ou \citet ou \citep ...

[rebouxo]

Il faut effectivement utiliser un style de biblio. Le monde des fichiers bst étant particulièrement pas lisible pour les êtres humains normaux, il faut utiliser l'extension biblatex. Tu trouves le fichiers sur CTAN (mais il n'est pas encore dans MiKteX ou dans TeXlive). C'est userfriendly. On peut faire ce que l'on veut comme présentation. C'est bien plus souple que les natbib ou jurabib, même si c'est encore en développement.

Olivier

[pavel_vikanov]

Je finis de remplir mon ***.bib et je regarde tout ça ! Plus que 44 réfs...

[pavel_vikanov]

J'ai regardé un peu biblatex et apparemment c'est beaucoup de trucs à gérer alors que finalement je n'ai qu'un reproche à faire à la biblio style "plain" : mettre les citations sous forme de [1], [2), .. alors que je souhaiterais [auteur, année]. Y'a pas un bst qui fasse juste ça ?

A priori frbib.sty et frcomplet.bst font ce que je souhaite, mais à la compilation il me crée un mon_document.bbl qui provoque cette erreur et pourtant le résultat final est nikel :

Code: Tout sélectionner

[PDFLaTeX] chartpage.tex => chartpage.pdf (pdflatex)
[PDFLaTeX] finished with exit status 1
./chartpage.bbl:4:Undefined control sequence. A.J. \fsc
./chartpage.bbl:4:Undefined control sequence. A.J. \fsc\bgroup Bednar\egroup{}, V.F. \fsc
./chartpage.bbl:5:Undefined control sequence. \fsc
./chartpage.bbl:5:Undefined control sequence. ...sc\bgroup Ulmer-Scholle\egroup{}, B.A. \fsc
./chartpage.bbl:6:Undefined control sequence. \fsc
./chartpage.bbl:6:Undefined control sequence. \fsc\bgroup Johnson\egroup{}, W.N. \fsc
./chartpage.bbl:7:Undefined control sequence. S.L. \fsc
./chartpage.bbl:13:Undefined control sequence. G.~\fsc
./chartpage.bbl:18:Undefined control sequence. G.~\fsc
./chartpage.bbl:18:Undefined control sequence. G.~\fsc\bgroup Bitton\egroup{}, K.~\fsc
./chartpage.bbl:19:Undefined control sequence. B.~\fsc
./chartpage.bbl:25:Undefined control sequence. P.~\fsc
./chartpage.bbl:25:Undefined control sequence. P.~\fsc\bgroup Blanco\egroup{}, F.~\fsc
./chartpage.bbl:26:Undefined control sequence. J.C. \fsc
./chartpage.bbl:32:Undefined control sequence. P.~\fsc
./chartpage.bbl:32:Undefined control sequence. P.~\fsc\bgroup Blanco\egroup{}, F.~\fsc
./chartpage.bbl:33:Undefined control sequence. J.C. \fsc
[PDFLaTeX] 17 errors, 0 warnings, 0 badboxes

[ViewPDF] chartpage.pdf (kpdf)
[ViewPDF] Done!

Pour infos, voici le ***.bbl qu'il crée automatiquement :

Code: Tout sélectionner

\begin{thebibliography}{}

\bibitem[Bednar \textit{et~al.}, 2007]{bednar2007}
A.J. \fsc\bgroup Bednar\egroup{}, V.F. \fsc\bgroup Medina\egroup{}, D.S.
  \fsc\bgroup Ulmer-Scholle\egroup{}, B.A. \fsc\bgroup Frey\egroup{}, B.L.
  \fsc\bgroup Johnson\egroup{}, W.N. \fsc\bgroup Brostoff\egroup{}, \andname{}
  S.L. \fsc\bgroup Larson\egroup{}.
\newblock Effects of organic matter on the distribution of uranium in soil and
  plant matrices.
\newblock {\em Chemosphere}, 70:237--347, 2007.

\bibitem[Bernhard, 2005]{bernhard2005}
G.~\fsc\bgroup Bernhard\egroup{}.
\newblock Speciation of uranium in environmental relevant compartments.
\newblock {\em Landbauforschung Völkenrode}, 3:139--148, 2005.

\bibitem[Bitton \textit{et~al.}, 1994]{bitton1994}
G.~\fsc\bgroup Bitton\egroup{}, K.~\fsc\bgroup Jung\egroup{}, \andname{}
  B.~\fsc\bgroup Koopman\egroup{}.
\newblock Evaluation of a microplate assay specific for heavy metal toxicity.
\newblock {\em Archives of Environmental Contamination and Toxicology},
  27:25--28, 1994.

\bibitem[Blanco \textit{et~al.}, 2004]{blanco2004}
P.~\fsc\bgroup Blanco\egroup{}, F.~\fsc\bgroup Vera~Tomé\egroup{}, \andname{}
  J.C. \fsc\bgroup Lozano\egroup{}.
\newblock Sequential extraction for radionuclide fractionation in soil samples:
  a comparative study.
\newblock {\em Applied Radiation and Isotopes}, 61:345--350, 2004.

\bibitem[Blanco \textit{et~al.}, 2005]{blanco2005}
P.~\fsc\bgroup Blanco\egroup{}, F.~\fsc\bgroup Vera~Tomé\egroup{}, \andname{}
  J.C. \fsc\bgroup Lozano\egroup{}.
\newblock Fractionation of natural radionuclides in soils from a uranium
  mineralized area in the south-west of spain.
\newblock {\em Journal of Environmental Radioactivity}, 79:315--330, 2005.

\end{thebibliography}

A quoi cela peut-être dû ?

[OG]

bonjour

Il faudrait donner un ECM (même avec une seule référence biblio).
As-tu mis \usepackage[french]{babel} ?
Peut-être que frcomplet.bst ne marche plus avec le french de babel, à cause de \fsc
qui en théorie met en capital le mot qui suit ?

O.G.

[pavel_vikanov]

Il faudrait donner un ECM (même avec une seule référence biblio).

Avec plaisir, mais c'est quoi un ECM ?

As-tu mis \usepackage[french]{babel} ?

ouep !

[OG]

Il faudrait donner un ECM (même avec une seule référence biblio).

Avec plaisir, mais c'est quoi un ECM ?

As-tu mis \usepackage[french]{babel} ?

ouep !

ECM "exemple concret minimal". Inutile donc de nous donner ta thèse à relire par exemple

O.G.

[pavel_vikanov]

Bon, j'ai essayé de ré-obtenir les erreurs ( ) d'avant avec ce frbib.sty et frcomplet.bst mais pas moyen. Il bug dans tous les sens, conserve les anciennes références, ne trouve pas les nouvelles, ..., bref je pense que je vais me plonger dans biblatex quand j'aurai le temps ! Dommage que ce "plain" me mette pas juste [auteur, date], je m'en serais largement contenté !!

edit : j'ai finalement retrouvé un fichier qui fonctionne avec le style et le bst cités plus haut, de toutes façons il fait des trucs moches dans la bibliographie en elle-même : il met des majuscules à tous les noms, enlève les majuscules dans les titres, ... Je vais vraiment me mettre à biblatex !

[OG]

Certains fichiers sont créés et utilisés à la prochaine compilation. Les erreurs se suivent mais si tu changes
ton fichier LaTeX, ne se ressemblent pas toujours.
Dans un répertoire tout neuf, mets juste un ECM (fichier LaTeX, fichier bib), testes et donnes nous les erreurs.
As-tu essayé fr-apalike ?

O.G.

[pavel_vikanov]

mon fichier *.tex :

Code: Tout sélectionner

%--------DOCUMENT---------------------------------------------

\documentclass[12pt,a4paper]{report}                           % type de document : book, report, article, slide, letter
\usepackage[T1]{fontenc}                                       % correspondance clavier > document
\usepackage[french]{babel}                                     %
\usepackage[latin1]{inputenc}                                  %
\usepackage{lmodern}                                           %


%---------PACKAGES---------------------------------------------

%\usepackage{abstract}                                          % résumé
\usepackage{amsmath,amsfonts,mathrsfs}                         % gestion formule math
\usepackage{cite}                                              % citations de la biblio
\usepackage{enumerate}                                         % gestion liste
\usepackage{eurosym}                                           % symbole euro
\usepackage{fancyhdr}                                          % en-tête et pied de page
\usepackage{float}                                             % gestion objets flottants
\usepackage{frbib}                                             % biblio en mode français
\usepackage{geometry}                                          % définition des marges
\usepackage{graphicx,epsf}                                     % insertion images
  \graphicspath{{images/}}                                     % chemin(s) du(des) dossier(s) d'images
\usepackage{here}
\usepackage{lastpage}
%\usepackage{makeidx}                                           % indexation
%\usepackage{numprint}                                          % gestion des styles d'écriture scientifiques dans ``math'' et ``text''
\usepackage{openbib}                                           % gestion biblio
\usepackage{tabularx}                                          % gestion tableau
\usepackage{xspace}                                            % optimisation espace typographique


%---------PAGE DE SORTIE---------------------------------------

\geometry{right=1.5cm}                                         % taille des marges

\renewcommand{\baselinestretch}{1.5}                           % taille de l'interligne

\setlength{\parindent}{0.5cm}                                  % taille indentation en début de paragraphe
\setlength{\parskip}{0.7cm}                                    % espacement vertical entre paragraphes

\hoffset=0pt                                                   % marge horizontale : 2.54cm - X
\voffset=-43pt                                                 % marge verticale : 2.54cm - X
\oddsidemargin=0pt                                             % séparation marge / corps (horizontale)
\topmargin=0pt                                                 % séparation marge / corps (verticale)
\headheight=15pt                                               % taille de l'en-tête
\headsep=50pt                                                  % distance entre le bas de l'en-tête et le corps
\textheight=690pt                                              % hauteur du corps
\textwidth=455pt                                               % largeur du corps
\footskip=44pt                                                 % distance entre le bas du corps et le bas du pied de page

\pagestyle{fancy}


%---------EN-TETE ET PIED DE PAGE------------------------------

\renewcommand{\headrulewidth}{0.8pt}                           % épaisseur du trait après l'en-tête
\renewcommand{\footrulewidth}{0.0pt}                           % épaisseur du trait avant le pied de page

%\lhead{}
\chead{Janvier 2010}
%\rhead{}
%\lfoot{}
\cfoot{\thepage{}}
%\rfoot{}


%---------PAGE DE GARDE----------------------------------------

\title{Caractérisation des sols utilisés pour les manipulations futures}       % titre
\author{Antoine~Tailliez}                                                      % auteur
\date{\today}                                                                  % date


%---------DEBUT DU COCUMENT------------------------------------
 
\begin{document}

\maketitle

%\tableofcontents

 
   \subsection*{Contexte et objectifs de la thèse}
   
     \input{tex/contexte}
   
   \subsection*{Comment choisir les sols utilisés pour les manipulations ?}
   
     \input{tex/choix_sols}
   
   \subsection*{Généralités sur l'uranium et son comportement dans les sols}
   
     \input{tex/uranium}
   
   \subsection*{Manipulations envisagées}
   
     \input{tex/manip}


  \bibliographystyle{frcomplet}                                          % plain de base, sinon frcomplet.bst avec frbib.sty
  \bibliography{bibliography_antoine}


\end{document}

mon fichier *.bib :

Code: Tout sélectionner

@article{bitton1994,
     author = {Bitton, G. and Jung, K. and Koopman, B.} ,
     title = {Evaluation of a microplate assay specific for heavy metal toxicity} ,
     journal = {Archives of Environmental Contamination and Toxicology} ,
     volume = {27} ,
     pages = {25-28} ,
     year = {1994}
}


@article{blanco2004,
     author = {Blanco, P. and Vera Tomé, F. and Lozano, J.C.} ,
     title = {Sequential extraction for radionuclide fractionation in soil samples: a comparative study} ,
     journal = {Applied Radiation and Isotopes} ,
     volume = {61} ,
     pages = {345-350} ,
     year = {2004}
}

Ce qu'il m'indique à la compilation :

Code: Tout sélectionner

[PDFLaTeX] chartpage.tex => chartpage.pdf (pdflatex)
./chartpage.tex:0:No file chartpage.aux.
./tex/contexte.tex:5: Citation `ciesielski1997' on page 1 undefined on input line 5.
./tex/contexte.tex:5: Citation `grossmann2007' on page 1 undefined on input line 5.
./tex/choix_sols.tex:5: Citation `echevarria2001' on page 2 undefined on input line 5.
./chartpage.tex:0:No file chartpage.bbl.
./chartpage.tex:0: There were undefined references.
./chartpage.tex:0: Label(s) may have changed. Rerun to get cross-references right.
[PDFLaTeX] 0 errors, 7 warnings, 0 badboxes
[PDFLaTeX] Done!

[BibTeX] chartpage.aux => chartpage.bbl (bibtex)
[BibTeX] Done!

[PDFLaTeX] chartpage.tex => chartpage.pdf (pdflatex)
./tex/contexte.tex:5: Citation `ciesielski1997' on page 1 undefined on input line 5.
./tex/contexte.tex:5: Citation `grossmann2007' on page 1 undefined on input line 5.
./tex/choix_sols.tex:5: Citation `echevarria2001' on page 2 undefined on input line 5.
./chartpage.bbl:16:Underfull \hbox (badness 5681) in paragraph
./chartpage.tex:0: There were undefined references.
./chartpage.tex:0: Label(s) may have changed. Rerun to get cross-references right.
[PDFLaTeX] 0 errors, 5 warnings, 1 badbox
[PDFLaTeX] Done!

[PDFLaTeX] chartpage.tex => chartpage.pdf (pdflatex)
./chartpage.bbl:16:Underfull \hbox (badness 5681) in paragraph
[PDFLaTeX] 0 errors, 0 warnings, 1 badbox
[PDFLaTeX] Done!

En résumé : il met les trucs comme il faut dans le texte, ne m'ouvre pas le *.bbl de la fois dernière en faisant plein d'erreurs, mais par contre dans la partie bibliographie il écrit les noms des auteurs en majuscules sauf celui du dernier ( ), et pour faire dans le détail, il met pas en gras le numéro de volume mais ça à la rigueur je m'en fous !

[OG]

là-tout-de-suite-maintenant je dois taper mon cours sur les méthodes numériques en finance
et je n'y comprends rien (à la finance).
Promis je reviens sur ton sujet d'ici mercredi, voire jeudi.

O.G.

[pavel_vikanov]

Pas de soucis, ça me fait malheureusement une bonne excuse pour écrire et faire un peu de biblio !!

[rebouxo]

ECM "exemple concret minimal". Inutile donc de nous donner ta thèse à relire par exemple

Hihihi. Tu veux un vrai exemple minimal (une thèse minimale par exemple, nouveau concept à breveté) ou un exemple complet minimal

Le problème des bst c'est que quand ce qui existe ne te plait pas, en modifier un pourkeçamarche est souvent trèpénible.com. Alors que l'on peut faire un peu ce que l'on veut facilement avec biblatex (et c'est parfois déjà fait). Bon si c'est une thèse de math demande bien si on accepte autre chose que ces illisibles crochets.

Olivier

[EricK]

Si tu veux du auteur (année), tu utilises natbib avec

Code: Tout sélectionner

\usepackage[square]{natbib}

et après le begin{document}

Code: Tout sélectionner

\bibliographystyle{abbrvnat}

et tu insères ta biblio avec

Code: Tout sélectionner

\nocite{*}
\bibliography{monfichierbib}

dans ton fichier principal.

Ça marche tout seul (je le fais régulièrement).

[pavel_vikanov]

Je teste ça !

Et non, c'est pas une thèse de maths mais un mix entre géologie et physiologie végétale !

[pavel_vikanov]

Bon j'ai testé natbib et la mise en forme ne me convient pas ! En plus je ne sais pas pourquoi, il ne met que l'initiale du nom de famille du dernier auteur quand il cosntruit la biblio ! Weird !

[pavel_vikanov]

edit : question bête sans doute, mais comme j'utilise un compte sur un serveur et que les dossiers avec l'install de latex sont inaccessibles, comment je peux faire pour utiliser les packages qui demandent plus qu'un *.sty ou *.bst pour fonctionner ? Notamment biblatex ou babelbib. Comment je peux dire à latex d'aller chercher des packages dans un dossier de ma session par exemple, si c'est possible !?